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Welcome to GenoGlobe.com!

Welcome to Haeyoung JEONG's official website, GenoGlobe.com! My secondary domain (GenoGlobe.kr) will be forwarded to this website.

I am a molecular biologist and genome scientist working for Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology. GenoGlobe means Genome + Globe, which implies my desire to learn from genomes and lives on earth (or other planets, such as Mars?). You can read more about my professional research profile from ORCiD or Google Scholar.

Please visit my blog if you want to send me a message through contact form (only shown from PC browsers) or use this form directly: Send Feedback

엄격한 기준으로 구분하였을 때 학술 논문이 아닌 것으로서 외부 매체에 기고했던 글 목록은 여기를 참고하십시오. 주로 미생물 유전체를 다루는 생명정보학과 관련하여 제가 작성한 글은 별도의 위키 사이트에 있습니다. 블로그에는 업무 및 취미와 관련한 잡다한 글이 있습니다. 블로그에는 저에게 이메일을 보낼 수 있는 양식이 있으니 참고하십시오. 단, PC 버전의 웹브라우저에서만 보이는 것 같습니다. 또는 다음을 클릭하세요: Send Feedback

이곳은 원래 저의 취미와 관련한 글을 체계적으로 작성하기 위해 만든 DokuWiki 기반의 웹사이트였다가 2023년 9월 7일 GenoGlobe.com의 공식 웹사이트 역할을 겸하게 되면서 다소 복합적인 성격을 갖게 되었습니다. 위키 기반이지만 첫 페이지는 블로그 형식(아래의 '새 소식')이라서 더욱 그렇습니다. '새 소식'은 자료를 모아서 분석하고 오래 생각하여 쓰는 글이 아닙니다. 저에게 이곳은 트위터나 페이스북과 같은 것으로, 예전에 사용하던 Google+를 대신하여 가벼운 생각을 기록하는 곳에 해당합니다. ChatGPT에게 키워드를 제시하고 자동으로 쓴 글도 포함되어 있으며, 이러한 글은 마지막 부분에 자동 작성된 것임을 밝혀 놓았습니다.


새 소식

What is the '-' Key on the Keyboard? (키보드의 '-'는 무엇인가?)

일반적인 키보드의 '-' 키(숫자 0 옆, Shift 없이 입력하는 것)는 하이픈(hyphen, -) 으로 정의된다.

하이픈(Hyphen, -)

  • 기본: 단어 연결 (예: data-driven) 이나 줄바꿈 표시
  • 키보드에서 입력되는 기본 기호
  • ASCII 코드 45 (U+002D)

마이너스(Minus sign, −)

  • 수학적 기호 전용
  • 하이픈보다 약간 길고 위치가 다름
  • 유니코드 U+2212 (−)
  • 수식이나 논문에서는 이 기호 사용이 권장됨

엔 대시(En dash, –)

  • 하이픈보다 길다
  • 범위 표현: 예) 2020–2025
  • 유니코드 U+2013 (–)

엠 대시(Em dash, —)

  • 가장 긴 대시
  • 문장에서 강한 구분, 삽입에 사용
  • 유니코드 U+2014 (—)

정리

  • 키보드에서 바로 입력되는 -하이픈(-)
  • 마이너스(−), 엔 대시(–), 엠 대시(—) 는 별도의 유니코드 문자
  • 일반 키보드로 직접 입력 불가 → 특수문자 입력이나 자동 교정 기능을 통해 사용해야 함

저자 및 이용 안내

이 문서는 정해영의 아이디어와 지시에 따라 AI 도구(ChatGPT)의 도움을 받아 작성되었습니다.

본 문서는 Creative Commons CC0 1.0 Universal Public Domain Dedication에 따라 누구나 자유롭게 복제, 수정, 배포, 활용할 수 있으며, 출처 표시도 필요하지 않습니다. 다만, 내용의 정확성은 보장되지 않았으며, 정해영은 본 문서의 내용에 대해 어떠한 법적 책임도 지지 않습니다.

Authorship and Usage Notice

This document was written with the assistance of an AI tool (ChatGPT), based on the ideas and direction provided by Haeyoung Jeong.

It is released under the Creative Commons CC0 1.0 Universal Public Domain Dedication. Anyone may freely copy, modify, distribute, and use the content, with no requirement for attribution. However, the accuracy of the content is not guaranteed, and Haeyoung Jeong assumes no legal responsibility for its use.

2025/09/10 12:17 · hyjeong

공무원 수 증가의 법칙

공무원 수 증가의 법칙. 한겨레 2025년 9월 8일

파킨슨의 법칙: 공무원의 숫자는 업무량의 증가와 직접적인 관계 없이 정부와 공무원의 심리적 요인에 의해서 계속하여 증가한다.

서로에게 더 많은 일을 만들어주기 때문에 모두 바쁘게 일하는 것처럼 보이고, 
오히려 ㄱ씨는 예전보다 더욱 바쁘게 일하게 된다.
2025/09/09 10:55 · hyjeong

Pointers and Memory Efficiency (포인터와 메모리 절약)

1. 포인터란?
  • 메모리 주소를 저장하는 변수
  • 예시:
int a = 10;
int* p = &a;  // p는 a의 주소를 저장
  • `p` 자체에는 주소가 들어있음
  • `*p`를 하면 그 주소가 가리키는 값(예: 10)을 읽거나 수정할 수 있음
2. 배열과 포인터의 관계
  • 배열 이름은 배열 첫 원소의 주소와 같음
  • 예시:
char str[] = "Piano";
char* p = str;  // p == &str[0]
  • 차이점:
    • `str`은 상수 주소 (다른 곳을 가리킬 수 없음)
    • `p`는 다른 문자열을 가리킬 수 있음
3. 문자열 저장 방식 비교
(1) 2차원 배열 (비효율적)
char names[3][12] = {"Piano", "Guitar", "Violin"};
  • 모든 문자열이 고정 크기(12바이트)를 차지
  • 남는 공간은 낭비
  • 전체가 SRAM에 저장됨 → 아두이노에서 메모리 부족 위험
(2) 포인터 배열 (효율적)
const char* names[3] = {"Piano", "Guitar", "Violin"};
  • RAM에는 문자열 주소(포인터)만 저장 (2바이트씩)
  • 실제 문자열은 플래시 메모리에 저장됨
  • 훨씬 효율적
4. 다차원 배열 vs 포인터 배열
  • 다차원 배열: 데이터가 메모리에 연속적으로 배치됨
  • 포인터 배열: 주소 목록만 있고, 실제 데이터는 흩어져 있음
  • 포인터 배열은 유연하지만 관리가 까다로울 수 있음
5. PROGMEM과의 관계
  • Arduino(AVR)에서는 문자열 리터럴이 플래시에 저장됨
  • `const char*`만으로도 대부분 플래시에 저장됨
  • 확실히 플래시에만 보관하려면 `PROGMEM` 사용:
const char string_0[] PROGMEM = "Piano";
const char* const names[] PROGMEM = { string_0 };
  • 꺼낼 때는 `pgm_read_word()` 필요 → 코드가 복잡해짐
6. 잘못 쓸 때의 문제
  • 포인터가 잘못된 주소를 가리키면 → 세그멘테이션 오류 / 오동작
  • `const char*` 문자열은 읽기 전용
  • `strcpy()` 같은 함수로 덮어쓰면 에러 발생
7. Arduino에서의 결론
  • 문자열은 포인터 배열(`const char*`)로 관리하는 것이 가장 효율적
  • GM 악기명: `const char* gmNames[128]`
  • 드럼킷 이름: `const char* drumKitNames[]`
  • 필요시 `struct`로 확장 (MSB, LSB, PC 함께 관리 가능)

8. 실제 예시: gm_gs_names.h (배열 버전)
// GM 악기 이름 (128개)
const char* gmNames[128] = {
  "AcouPiano1", "AcouPiano2", "ElecGrand", "HonkyTonk",
  "ElecPiano1", "ElecPiano2", "Harpsi", "Clavi",
  // ... (중략) ...
  "Gunshot"
};
 
// 드럼킷 이름 (9개, CleanWave32 기준)
const char* drumKitNames[] = {
  "Standard", "Room", "Power", "Electronic",
  "TR-808", "Jazz", "Brush", "Orchestra", "SFX"
};
 
// LCD 표시 예시
void renderLCD(uint8_t channel, uint8_t pc) {
    char line2[17];
    if (channel == 10) {
        snprintf(line2, sizeof(line2), "D:%-10s", drumKitNames[pc]);
    } else {
        snprintf(line2, sizeof(line2), "%-12s %03d", gmNames[pc], pc);
    }
    lcd.setCursor(0, 1);
    lcd.print(line2);
}

9. 확장 예시: 드럼킷 구조체 버전

드럼킷은 이름뿐 아니라 MSB/LSB/Program Change 번호도 필요할 수 있음. 이 경우 구조체를 정의해서 더 체계적으로 관리 가능.

// 드럼킷 정보 구조체
struct DrumKit {
    const char* name;
    uint8_t msb;
    uint8_t lsb;
    uint8_t pc;
};
 
// 드럼킷 배열 (CleanWave32 기준)
const DrumKit drumKits[] = {
    {"Standard",   121, 0, 0},
    {"Room",       121, 0, 1},
    {"Power",      121, 0, 2},
    {"Electronic", 121, 0, 3},
    {"TR-808",     121, 0, 4},
    {"Jazz",       121, 0, 5},
    {"Brush",      121, 0, 6},
    {"Orchestra",  121, 0, 7},
    {"SFX",        121, 0, 8}
};
 
// 드럼킷 선택 함수
void selectDrumKit(uint8_t index) {
    midiSendControlChange(0, drumKits[index].msb, 10);   // CC#0 = MSB
    midiSendControlChange(32, drumKits[index].lsb, 10);  // CC#32 = LSB
    midiSendProgramChange(drumKits[index].pc, 10);       // PC
    lcd.setCursor(0,1);
    lcd.print(drumKits[index].name);
}

요약: 포인터 배열을 쓰면 문자열 이름을 플래시에 두고 RAM은 주소만 저장하기 때문에 메모리를 크게 절약할 수 있다. 드럼킷은 단순히 이름만 관리할 수도 있지만, MSB/LSB/PC까지 구조체에 넣어 관리하면 MIDI 제어가 훨씬 깔끔해진다.


저자 및 이용 안내

이 문서는 정해영의 아이디어와 지시에 따라 AI 도구(ChatGPT)의 도움을 받아 작성되었습니다.

본 문서는 Creative Commons CC0 1.0 Universal Public Domain Dedication에 따라 누구나 자유롭게 복제, 수정, 배포, 활용할 수 있으며, 출처 표시도 필요하지 않습니다. 다만, 내용의 정확성은 보장되지 않았으며, 정해영은 본 문서의 내용에 대해 어떠한 법적 책임도 지지 않습니다.

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This document was written with the assistance of an AI tool (ChatGPT), based on the ideas and direction provided by Haeyoung Jeong.

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2025/09/05 20:44 · hyjeong

Metabolic syndrome

대사증후군

이 문서는 2024년 Nature Reviews Disease Primers에 실렸던 리뷰 논문 Metabolic Syndrome(원문 링크)을 챗GPT를 사용하여 번역 및 요약한 것이다. 분당서울대병원 임수 교수가 저자로 참여한 이 논문은 BRIC에도 소개되었다(한빛사연구성과). 번역 및 요약은 ChatGPT를 통하여 실시하였다.

서론

대사증후군(MetS)은 복부 비만, 인슐린 저항성, 이상지질혈증, 고혈압, 고혈당 등 서로 연관된 위험 요인들의 집합으로, 심혈관질환(CVD), 제2형 당뇨병(T2DM), 만성신장질환(CKD), 조기 사망의 가능성을 높인다. 20세기 말 “X 증후군”으로 처음 개념화된 이후, MetS는 전 세계적으로 인정받는 임상적 실체가 되었다. 정의와 진단 기준에 대한 논란이 여전히 존재하지만, MetS는 위험 평가, 조기 발견, 개입의 실용적 틀로 기능한다. 최근 수십 년 동안 MetS의 유병률은 도시화, 좌식 생활, 고열량 식단의 확산에 따라 급격히 증가했다. 이 요약은 역학, 병태생리, 진단·예방·관리, 미래 전망을 종합해 제시한다.

역학

MetS의 유병률은 지역과 집단에 따라 크게 다르며, 유전, 생활습관, 사회경제적 요인에 의해 영향을 받는다.

  • 미국: 2011–2018년 NHANES 자료에 따르면 37.6%에서 41.8%로 증가. 주된 원인은 공복혈당 증가이며, 사회경제적 취약층에서 더 높은 부담을 보임.
  • 캐나다: 약 42% 유병률, 남성이 더 위험하나 사회적 박탈은 여성에게 집중됨.
  • 멕시코: 남성 28.9%, 여성 44.4%로 높은 유병률. 복부 비만과 낮은 HDL이 주요 요인.
  • 유럽: 진단 기준에 따라 10~30% 범위. UK Biobank 등 대규모 연구에서 불안, 염증, CVD 발생과의 연관 확인.
  • 아시아: 일본과 한국에서 최근 수십 년간 급증. 한국은 2001년 27.1%에서 2020년 33.2%로 증가. 중국은 19~31% 수준. 남아시아인은 낮은 BMI에서도 높은 위험.
  • 저·중소득국가: 도시화와 자원 부족으로 유병률 급증.

전 세계적으로 성인의 약 4분의 1이 진단 기준을 충족하며, 아동·청소년에서도 증가세가 뚜렷하다.

병태생리와 기전

MetS는 유전적 소인, 환경, 생활습관의 상호작용에서 비롯된다.

  • 내장 및 이소성 지방 축적: 복부 내장 지방이 가장 강력한 위험 요인. 간·췌장·심장·신장 등에 지방이 축적되면 인슐린 저항성 및 장기 손상 유발.
  • 인슐린 저항성: 대사증후군의 중심 기전. 고혈당, 이상지질혈증, 내피기능 장애를 촉진.
  • 지방조직 기능장애: 비대 지방세포는 지방분화 저하, 염증, 섬유화 증가, 지방산 유출을 유발.
  • 전신 염증: 사이토카인, CRP, 혈전성 마커 상승으로 혈관 손상 및 죽상경화 진행.
  • 신경호르몬 요인: 시상하부-뇌하수체-부신 축의 이상, 성호르몬 불균형, 수면장애 등이 위험을 가중.
  • 유전·후생유전학: 쌍생아 연구 및 MR 분석에서 내장 지방 분포와 심대사 위험의 유전적 기반 확인.

진단과 분류

WHO, NCEP-ATP III, IDF, AHA/NHLBI 등 여러 기준이 있으며, 대체로 다음 중 세 가지 이상을 만족하면 진단:

  • 복부 둘레 증가 (집단별 기준)
  • 중성지방 상승
  • HDL 저하
  • 혈압 상승
  • 공복혈당 상승

2009년 “조화 기준”이 국제적 합의안으로 제시되었으며, 2023년에는 AHA가 CKM(심혈관–신장–대사) 증후군으로 개념을 확장했다.

임상적 결과

MetS는 다음과 밀접히 관련된다:

  • 심혈관질환: 관상동맥질환, 뇌졸중, 심부전 등
  • 제2형 당뇨병: 인슐린 저항성이 β세포 기능 저하를 가속
  • 신장질환: 비만 관련 사구체병증, 신장 주위 지방 축적
  • 간질환: MASLD/NASH
  • 기타: 다낭성난소증후군, 수면무호흡증, 우울, 일부 암, 근골격계 질환

예방

생활습관 교정이 핵심이다.

  • 운동: 규칙적 운동이 내장 지방을 줄이고 인슐린 감수성 개선
  • 영양: DASH, 지중해식 식단이 혈압·지질·염증 개선
  • 체중관리: 복부 비만 예방
  • 공중보건 개입: 식품환경, 불평등, 신체활동 촉진 정책

관리

  • 생활습관 중재: 식사·운동·체중감소가 1차 치료
  • 약물치료: GLP-1 작용제 등 항비만제, 항고혈압제, 스타틴, 혈당강하제
  • 수술치료: 대사수술이 심한 비만에서 효과적
  • 통합 진료: 다학제 팀 기반 관리 필요

삶의 질과 사회심리적 차원

MetS는 피로, 우울, 낙인, 기능 저하 등 삶의 질을 악화시킨다. 정신건강, 수면, 사회적 요인을 함께 다루는 것이 중요하다.

전망

향후 과제는 다음과 같다:

  1. 진단 기준의 정교화
  2. 유전체·대사체·영상 기반 정밀의료
  3. 건강 형평성 확보
  4. 소아·청소년 조기 예방
  5. 글로벌 정책 조율

궁극적으로는 “질병 관리”를 넘어 “대사 건강”을 증진하는 방향으로 패러다임 전환이 필요하다.

초록 번역

대사증후군(MetS)은 심혈관질환, 제2형 당뇨병 및 기타 건강 결과에 영향을 미치는 다면적 조절가능한(modifiable) 위험 요인으로, 임상 현장과 공중보건 모두에 중대한 도전 과제로 자리하고 있다. 도시화, 좌식 생활, 식습관 변화에 의해 촉발된 MetS의 전 세계적 유병률 증가는 이 증후군에 대응해야 할 시급성을 강조한다. 본 문헌에서는 유전적 소인, 인슐린 저항성, 복부 비만에서의 기능장애성 지방조직 및 이소성 지질(ectopic lipids) 축적, 전신 염증, 이상지질혈증 등 복잡한 기저 기전을 탐구하고, 이들이 MetS의 임상적 발현에 어떻게 기여하는지를 살펴본다. 진단 접근법은 다양하지만 일반적으로 복부 비만(허리둘레 측정으로 평가), 고혈당, 이상지질혈증, 고혈압에 초점을 맞추고 있으며, 집단별·표현형별 특화 진단 전략의 필요성을 부각한다. MetS 관리의 기본은 건강한 식습관, 신체 활동, 과도한 내장지방 및 이소성 지방 관리 등 생활습관 교정에 두고 있다. 또한 신약 치료와 외과적 방법을 포함한 새로운 치료법을 논의하며, MetS 연구와 진료에 대한 미래 지향적 관점을 제공한다. 본 프라이머는 MetS의 복잡성을 임상의, 연구자, 정책결정자들에게 알리고, 일관되고 환자 중심적인 관리와 예방 전략을 옹호하는 것을 목표로 한다. MetS의 다인성 특성을 강조하며, 본 프라이머는 이 심화되는 건강 문제를 해결하기 위해 통합적 공중보건 노력, 개인 맞춤 진료, 혁신적 연구를 촉구한다.

2025/09/03 13:13 · hyjeong

Artificial Sweeteners and Gut Microbiome: A Double-Edged Sword

인공감미료와 장내 미생물: 양날의 검

Artificial sweeteners, or non-caloric artificial sweeteners (NAS), are widely used as sugar substitutes. They provide sweetness without calories, but growing evidence suggests they may not be metabolically inert. Recent studies indicate that NAS can alter the gut microbiome, potentially leading to glucose intolerance. Here we compare the characteristics of commonly used NAS and their possible impacts on health.

인공감미료(NAS, non-caloric artificial sweeteners)는 설탕을 대체하는 감미료로 널리 사용된다. 칼로리를 거의 제공하지 않으면서 단맛을 내지만, 최근 연구에서는 이들이 단순히 ‘중립적’이지 않을 수 있음을 보여주고 있다. 특히 장내 미생물(gut microbiome)의 구성을 바꾸어 포도당 불내성(glucose intolerance)을 유발할 수 있다는 가능성이 제기되었다. 여기서는 대표적인 NAS의 특징과 건강에 미칠 수 있는 영향을 비교한다.


Saccharin (사카린)

  • 특징: 최초의 인공감미료 중 하나, 강한 단맛.
  • 장내 미생물 영향: 연구에 따르면 장내 세균 다양성을 감소시키고, Proteobacteria 증가와 연관.
  • 건강 영향: Suez et al. (2014, *Nature*)에서 포도당 불내성과 직접적으로 연결됨이 보고됨.

Sucralose (수크랄로스)

  • 특징: Splenda®라는 이름으로 널리 사용, 열 안정성이 높아 가공식품에 흔히 첨가.
  • 장내 미생물 영향: Firmicutes 감소, Proteobacteria 증가, 일부 동물 모델에서 염증 반응 증가.
  • 건강 영향: 대사 교란 가능성 및 장 투과성 변화 보고.

Aspartame (아스파탐)

  • 특징: 설탕 대비 200배 단맛, 다이어트 음료에 흔히 사용.
  • 장내 미생물 영향: 소장에서 아미노산으로 분해되므로 직접적 영향은 제한적. 하지만 일부 연구에서 특정 균주 구성 변화 보고.
  • 건강 영향: 사카린/수크랄로스보다는 교란이 적으나, 대사 건강과의 연관성에 대한 논란은 여전히 존재.

Acesulfame K (아세설팜K)

  • 특징: 칼로리 0, 음료 및 베이킹에 널리 사용.
  • 장내 미생물 영향: 동물 실험에서 특정 세균 군집 변화 보고.
  • 건강 영향: 사카린/수크랄로스보다는 영향이 약하지만, 장내 발효에 일정한 변화 가능성.

Stevia (스테비아)

  • 특징: 식물 유래 천연 감미료, Rebaudioside A가 주요 성분.
  • 장내 미생물 영향: 상대적으로 안정적. 일부 연구에서는 비피도박테리움 증가 등 긍정적 결과.
  • 건강 영향: 전반적으로 안전성이 높은 편으로 평가.

Allulose (알룰로스)

  • 특징: 희귀당(rare sugar), 프럭토스의 C-3 에피머. 설탕 대비 70% 단맛, 칼로리는 거의 없음.
  • 장내 미생물 영향: 대사 영향이 거의 없으며, 일부 동물 연구에서 오히려 아커만시아·비피도박테리움 증가 경향.
  • 건강 영향: 포도당 대사 개선 효과 보고, NAS 중 가장 안전성이 높은 후보로 평가됨.

종합 비교표

감미료 장내 미생물 영향 포도당 불내성과의 연관성
사카린 다양성 감소, Proteobacteria 증가 높음 (강력한 연관 보고)
수크랄로스 Firmicutes 감소, 염증 증가 중간 ~ 높음
아스파탐 제한적 변화, 특정 균주 변화 낮음 ~ 불확실
아세설팜K 일부 변화 낮음 ~ 중간
스테비아 긍정적 효과 가능 매우 낮음
알룰로스 영향 거의 없음, 일부 유익균 증가 없음 ~ 개선 가능

결론

인공감미료는 “칼로리 없는 단맛”을 제공하지만, 장내 미생물 군집에 변화를 일으켜 대사 건강에 영향을 줄 수 있다는 점에서 주의가 필요하다. 특히 사카린과 수크랄로스는 포도당 불내성 유발과 강하게 연관되어 있으며, 반면 스테비아와 알룰로스는 상대적으로 안전하고 긍정적인 가능성까지 제시된다.

향후 연구는 인공감미료의 장기 섭취가 인간의 장내 미생물과 대사 건강에 미치는 영향을 더 정밀하게 밝혀야 할 것이다.


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2025/09/02 10:30 · hyjeong

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start.txt · Last modified: by hyjeong