$ java -version
java version "1.6.0_38"
OpenJDK Runtime Environment (IcedTea6 1.13.10) (6b38-1.13.10-0ubuntu0.12.04.1)
OpenJDK 64-Bit Server VM (build 23.25-b01, mixed mode)
$

$ /usr/local/Bio/FastQC/fastqc (GUI mode; Xming을 미리 실행해야 함)
$ /usr/local/Bio/FastQC/fastqc BL21-20x_1.fastq BL21-20x_2.fastq [file_3 file_4...]
$ firefox firefox BL21-20x_1_fastqc.html (Xming을 미리 실행해야 함)

* 윈도에서는 run_fastq.bat를 실행하여 GUI 모드로 작업 권장

• PRINSEQ 서버(local installation 가능)를 이용하여 포맷 전환, 필터링 및 트리밍 등의 기능도 활용할 수 있음
• 이외에도 Trimmomatic, Cutadapt, SolexaQA++ 등의 다양햔 QC/전처리 소프트웨어가 공개되어 있음. Software for pre-processing Illumina next-generation sequencing short read sequences(Code for Biology and Medicine 2014, 9:8) 참고.
• Question: Selecting random pairs from fastq?