• User manual(온라인 매뉴얼 및 PDF 매뉴얼)
• 튜토리얼 보관소
• 박테리아를 위한 transcriptome analysis(내부문서)는 여기를 참조할 것

2017년 10월판(v10.1.1)을 기준으로 유전자 발현 분석 기능은 Toolbox의 RNA-Seq Analysis와 Microarray and Small RNA Analysis에 위치한다. 과거에는 Toolbox의 Transcriptomics Analysis라는 폴더 내에 RNA-Seq Analysis 기능이 있었다.

CLC에서는 raw RNA-seq file로부터 매핑, QC, 발현 분석과 plotting을 하는 것 외에도 csv 파일로 이루어진 expression data를 임포트하여 분석하는 것도 가능하다. 요즘 권장되는 것은 메타데이터 파일을 만들어서 여기에 종속된 데이터 파일(및 중간 결과물 파일)을 간적 간접적으로 다루는 것이다.

메타데이터 파일은 외부에서 엑셀로 만든 것을 임포트해도 되고, 정보량이 많지 않다면 File → New → Metadata Table에서 직접 작성해도 무방하다.