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bioinfo:ont_sequencing_data_analysis

Data analysis for Oxford Nanopore sequencing

  • MinION Mk1B (product code MIN-101B)
  • Flow cell: Spot-On Flow cell MkI (product code FLO-MIN106 R9)
  • 구동용 컴퓨터: Xeon E5520 @2.27, 16 GB memory, Ubuntu 14.04.5 LTS

EPI2ME에서는 더 이상 basecall을 진행하지 않으므로 Albacore를 설치하여 local basecalling을 하라는 고객 센터의 알림이 있었다. 단, MinKNOW 설정 창의 Basecalling(Live or None 중에 선택)에서 나타나는 Live basecalling은 Albacore를 뜻하는 것이 아니라 1D sequencing protocol을 위해 내장된 것이다.

bioinfo/ont_sequencing_data_analysis.txt · Last modified: 2021/03/17 13:09 by 127.0.0.1