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bioinfo:ngs_read_simulator

NGS read simulator

각 시퀀싱 장비에서 만들어지는 read는 길이와 정확도 등 특성이 전부 다르다. 생명정보 분석 프로그램을 활용하기 위해서는 다양한 NGS read data를 다루어 보는 것이 중요하지만 실제의 데이터를 전부 생산해 볼 수는 없다. ART는 FASTA file이 있을 때 Roche/454나 Illumina 등의 특성에 맞는 read를 모사(simulation)하는 프로그램이다.

Oxford Nanopore Technology의 read를 만들어내는 NanoSim, DeepSimulator 등의 시뮬레이터도 있다.

bioinfo/ngs_read_simulator.txt · Last modified: 2023/06/21 13:16 by hyjeong