de_novo_assembly
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Table of Contents
De novo assembly
1. Velvet
(optional) Interleaved file의 준비
$ /usr/local/Bio/velvet_1.2.10/contrib/shuffleSequences_fasta/shuffleSequences_fastq.pl BL21-20x_1.fastq BL21-20x_2.fastq BL21-paired.fastq * 최근에는 -separate 옵션이 추가되어서 2개의 paired file을 그대로 공급해도 됨
2. A5-miseq (ngopt)
de_novo_assembly.1455581023.txt.gz · Last modified: 2021/03/17 13:09 (external edit)