bioinfo:kmer_analysis
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Table of Contents
K-mer analysis software
khmer
SGA preqc
KAT - The K-mer Analysis Toolkit
일반 정보
- 논문: KAT: a K-mer analysis toolkit to quality control NGS datasets and genome assemblies. Bioinformatics (2016) PubMed
설치
bioconda를 이용하여 설치하였다. CentOS 6.x에서 bioconda로 설치한 gnuplot은 약간 까다로운 에러를 발생한다.
gnuplot: error while loading shared libraries: libjpeg.so.8: cannot open shared object file: No such file or directory
차라리 $PATH 맨 앞에 /usr/local/bin(/gnuplot version 5.0 patchlevel 3)이 오게 만들어서 실행하는 것이 나을 것이다. 그러나 'set terminal png large size 1024,1024'를 문법적 에러로 인식할 수도 있다.
bioinfo/kmer_analysis.1536037521.txt.gz · Last modified: 2021/03/17 13:09 (external edit)