16S rRNA는 모든 미생물이 공통적으로 지니고 있으며 universal primer pair를 이용한 증폭이 가능하므로 이를 기반으로 미생물 집단의 다양성을 분석하는 metagenome analysis가 널리 시행되고 있다. 최근에는 단순한 taxonomic profiling에 그치지 않고 shotgun metagnomics에 의해서 미생물 집단의 기능 또는 대사경로를 비교 분석하는 방법의 중요성도 부각되고 있다. 미생물 프로파일링에 널리 쓰이는 16S rRNA 유전자의 구조와 증폭용 프라이머의 위치 및 서열 정보는 EZBioCloud 웹사이트를 참고하기 바란다. 천랩에서는 iSeq 100을 이용한 16S rRNA microbiome protocol을 개발하여 공개하기도 하였다(링크). 참고로 천랩은 CJ바이오사이언스가 되었다.