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building_myubuntu_distro

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building_myubuntu_distro [2022/07/25 14:19] – [check_circularity.pl 스크립트] hyjeongbuilding_myubuntu_distro [2022/07/25 14:21] (current) – [NCBI legacy blast] hyjeong
Line 206: Line 206:
   ANI.pl  check_circularity.pl  faSomeRecords  faSplit  run-mummer4.sh  st   ANI.pl  check_circularity.pl  faSomeRecords  faSplit  run-mummer4.sh  st
  
-==== NCBI legacy blast ====+==== NCBI legacy blast(License: Public Domain) ====
 ANI.pl과 pyani 실행에 필요하다. [[https://github.com/kad-ecoli/ncbi-blast-legacy|GitHub]]에서 [[https://github.com/kad-ecoli/ncbi-blast-legacy/releases/download/2.2.26/blast-2.2.26-x64-linux.tar.gz|blast-2.2.26-x64-linux.tar.gz]]를 가져다가 ~/apps 아래에서 압축을 푼다. ZGA pipeline의 dFAST annotation 과정에서는 여기에 포함된 rpsblast를 참조해서는 안된다. 따라서 ANI.pl 또는 pyani 실행 직전에 /home/kribb/bin/apps/blast-2.2.26/bin을 PATH에 포함시키도록 한다. ANI.pl과 pyani 실행에 필요하다. [[https://github.com/kad-ecoli/ncbi-blast-legacy|GitHub]]에서 [[https://github.com/kad-ecoli/ncbi-blast-legacy/releases/download/2.2.26/blast-2.2.26-x64-linux.tar.gz|blast-2.2.26-x64-linux.tar.gz]]를 가져다가 ~/apps 아래에서 압축을 푼다. ZGA pipeline의 dFAST annotation 과정에서는 여기에 포함된 rpsblast를 참조해서는 안된다. 따라서 ANI.pl 또는 pyani 실행 직전에 /home/kribb/bin/apps/blast-2.2.26/bin을 PATH에 포함시키도록 한다.
   $ cd ~/apps   $ cd ~/apps
building_myubuntu_distro.1658726372.txt.gz · Last modified: by hyjeong