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bioinfo:prokaryotic_genome_analysis_manual_2023

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bioinfo:prokaryotic_genome_analysis_manual_2023 [2023/08/17 09:10] – [목차] hyjeongbioinfo:prokaryotic_genome_analysis_manual_2023 [2025/07/03 12:31] (current) – [목차] hyjeong
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   - [[16S rRNA amplicon sequencing을 이용한 메타게놈 분석]]   - [[16S rRNA amplicon sequencing을 이용한 메타게놈 분석]]
   - [[Long read sequencing 결과물 다루기]]   - [[Long read sequencing 결과물 다루기]]
 +    - [[Long read assembly 2024]]
   - [[Long read 기반 유전체 조립 결과물의 후처리]]   - [[Long read 기반 유전체 조립 결과물의 후처리]]
   - [[TORMES pipeline을 이용한 bacterial WGS analysis]] <color #ed1c24>//완료//</color>   - [[TORMES pipeline을 이용한 bacterial WGS analysis]] <color #ed1c24>//완료//</color>
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   - [[[부록] 유용한 팁 모음]] <color #ed1c24>//완료//</color>   - [[[부록] 유용한 팁 모음]] <color #ed1c24>//완료//</color>
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 +      - [[Vsearch]]
 ===== 잡담 ===== ===== 잡담 =====
 예전에는 하나의 conda environment에 되도록 많은 응용프로그램을 설치하기 위해 많은 노력을 했었다. 그러나 요즘은 서로 의존성이 잘 맞지 않는 프로그램은 별도의 환경에 따로 설치하는 쪽으로 바뀌었다. 그렇게 하는 것이 훨씬 깔끔하고, 워낙 디스크 가격도 많이 내려갔으니 아끼려고 노력할 필요도 없다. 다만 내가 실행하려는 프로그램이 어느 환경에 들어가 있는지 잘 파악해 두어야 한다. 예전에는 하나의 conda environment에 되도록 많은 응용프로그램을 설치하기 위해 많은 노력을 했었다. 그러나 요즘은 서로 의존성이 잘 맞지 않는 프로그램은 별도의 환경에 따로 설치하는 쪽으로 바뀌었다. 그렇게 하는 것이 훨씬 깔끔하고, 워낙 디스크 가격도 많이 내려갔으니 아끼려고 노력할 필요도 없다. 다만 내가 실행하려는 프로그램이 어느 환경에 들어가 있는지 잘 파악해 두어야 한다.
bioinfo/prokaryotic_genome_analysis_manual_2023.1692231026.txt.gz · Last modified: by hyjeong