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bioinfo:consed_28_in_2024

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bioinfo:consed_28_in_2024 [2024/03/13 09:14] hyjeongbioinfo:consed_28_in_2024 [2024/03/13 09:26] (current) hyjeong
Line 19: Line 19:
   $ sudo apt update   $ sudo apt update
   $ sudo apt install libpng12-0   $ sudo apt install libpng12-0
-  $ ./consed_rhel6linux64bit -v+  $ ./consed_rhel6linux64bit -v
   Version 28.0 (141216)   Version 28.0 (141216)
  
-  $ ./installConsed.perl consed_linux32bit /usr/local/genome+installConsed.perl 스크립트를 이용하여 consed를 설치한다. 컴파일 과정에서 경고 메시지가 조금 나오지만 문제는 없다. 
 + 
 +  $ ./installConsed.perl consed_rhel6linux64bit /usr/local/genome
   ...   ...
   Success!  (I think.)   Success!  (I think.)
Line 32: Line 34:
   in the section INSTALLING CONSED   in the section INSTALLING CONSED
  
-  +phred, phrap 및 이들 패키지에 따로 포함된 실행파일(실제로는 make해야 함)은 /usr/local/genome/bin/에 복사해 둔다. 이어서 다음과 같이 실행하면 아주 친숙한 consed의 실행 화면을 만나게 될 것이다. 
 + 
 +  $ PATH=/usr/local/genome/bin:$PATH 
 +  $ cd /usr/local/genome/examples/standard/edit_dir 
 +  $ consed 
 + 
 +{{ :bioinfo:consed_28_screenshot.png?400 |}}
bioinfo/consed_28_in_2024.1710288872.txt.gz · Last modified: 2024/03/13 09:14 by hyjeong