metagenomics
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===== 16S rRNA-based ===== | ===== 16S rRNA-based ===== | ||
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GroopM, a companion of CheckM, can be used to recover genomes from metagenomic data.[[https:// | GroopM, a companion of CheckM, can be used to recover genomes from metagenomic data.[[https:// | ||
+ | ===== Shotgun metagenomic analysis 2022 ===== | ||
+ | 최근 들어서 입수한 메타게놈 자료의 분석을 위하여 새롭게 글 작성을 시작한다. 오래 전에 작성했던 위 내용의 해당 섹션을 보충하느니 차라리 새로운 섹션을 만들고, 필요하다면 별도의 위키 문서로 독립하는 것이 나을 것이다. Biostars에 실린 최근 질문과 답변(2022년 1월 20일 기준 4개월 전)이 훌륭한 시작점이 될 것이다. | ||
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+ | [[https:// | ||
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+ | Shotgun metagenomic analysis라고 하여 반드시 MAG(metagenome-assembled genome)을 중간물로 사용하는 것은 아니다. 예를 들어 마커 유전자 DB를 이용한 정밀한 phylogenetic analysis라면, | ||
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+ | [[metagenomic_data_assembly_pipeline]] | ||
metagenomics.1615954153.txt.gz · Last modified: 2021/03/17 13:09 by 127.0.0.1