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--- manipulation_of_ani_matrix_data_file_using_r [2023/02/15 16:59] – [Heatmap 그리기] hyjeong
+++ manipulation_of_ani_matrix_data_file_using_r [2023/02/15 17:04] (current) – [Label을 자유롭게 표시하기] hyjeong
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   > library(ComplexHeatmap)
   > Heatmap(as.matrix(ani), name="ANI", row_names_gp = gpar(fontsize = 5), column_names_gp = gpar(fontsize = 5))
+{{ :heatmap_20230215.png?400 |Heatmap()으로 그렸음.}}
 이번에는 row와 column을 서로 다른 방식으로 클러스터링해 보자. row는 임포트한 트리(ezTree_51_pfam_rooted.nwk, dendrogram 객체여야 함)를 기준으로 정렬하되 column은 ani 데이터프레임의 값으로 자체적인 클러스터링을 적용한다. 실제로 그려보니 별로 예쁘질 않다.
   > Heatmap(as.matrix(ani), name="ANI", cluster_rows = tree.2, row_names_gp = gpar(fontsize = 5), column_names_gp = gpar(fontsize = 5))
@@ Line 188: / Line 188: @@
   ...
   > Heatmap(as.matrix(ani), name = "ANI", row_labels = key.2[rownames(ani)], row_names_gp = gpar(fontsize = 5), column_names_gp = gpar(fontsize = 5))
+{{ :heatmap_20230215b.png?400 |Row label을 치환하여 그린 heatmap. 데이터프레임 자체의 row label은 바뀌지 않았다.}}
 ComplexHeatmap의 활용법을 자세히 알아보려면 [[https://jokergoo.github.io/ComplexHeatmap-reference/book/index.html|Complete Reference]]를 참고하기 바란다.