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genome_annotation

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genome_annotation [2018/08/20 15:26] – [실행 방법] hyjeonggenome_annotation [2021/03/17 13:09] (current) – external edit 127.0.0.1
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 ==== 실행 방법 ==== ==== 실행 방법 ====
 Prokka GitHub 사이트의 [[https://github.com/tseemann/prokka#invoking-prokka|Invoking Prokka]] 항목을 참조하라. Prokka GitHub 사이트의 [[https://github.com/tseemann/prokka#invoking-prokka|Invoking Prokka]] 항목을 참조하라.
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   $ prokka --kingdom Bacteria --outdir prokka_180820 --genus Escherichia --locustag LCV --rfam --cpus 24 pilon.fasta   $ prokka --kingdom Bacteria --outdir prokka_180820 --genus Escherichia --locustag LCV --rfam --cpus 24 pilon.fasta
  
 Locus tag을 지정하지 않으면 --outdir로 지정된 디렉토리 안에 같은 이름을 접두사로 하는 파일들이 생긴다. Locus tag을 지정하지 않으면 --outdir로 지정된 디렉토리 안에 같은 이름을 접두사로 하는 파일들이 생긴다.
genome_annotation.1534746401.txt.gz · Last modified: (external edit)