cog_assignment
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cog_assignment [2021/08/10 12:38] – [COGNITOR 실행] hyjeong | cog_assignment [2021/08/10 12:51] (current) – [Functional classification] hyjeong | ||
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Line 152: | Line 152: | ||
my @temp = split /,/, $_; | my @temp = split /,/, $_; | ||
if ($temp[12] =~ / | if ($temp[12] =~ / | ||
- | my ($start, $end) = ($1, $2); | + | |
} | } | ||
print OUT join ',', | print OUT join ',', | ||
Line 183: | Line 183: | ||
==== Functional classification ==== | ==== Functional classification ==== | ||
- | COG의 각 functional class에 몇 개씩의 유전자가 분포하는지를 집계하고 싶다면 [[cogclass2018.pl|COGclass2018.pl]] 스크립트를 이용하라. 하나의 COG에 대하여 복수의 functional class가 있는 경우는 무작위로 하나만 선택한다. | + | COG의 각 functional class에 몇 개씩의 유전자가 분포하는지를 집계하고 싶다면 [[cogclass2018.pl|COGclass2018.pl]] 스크립트를 이용하라. 하나의 COG에 대하여 복수의 functional class가 있는 경우는 무작위로 하나만 선택한다. 이게 최선이 아닌 줄은 알지만 어쩔 수가 없어서... |
$ COGclass2018.pl GenQuery.COG.csv.bestHit > COGclass | $ COGclass2018.pl GenQuery.COG.csv.bestHit > COGclass |
cog_assignment.1628566732.txt.gz · Last modified: 2021/08/10 12:38 by hyjeong