Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

--- bioinfo:pan-genome_analysis [2023/06/27 16:29] – [유전체의 1:1 비교를 통해서 특이적 서열을 영역 정보와 함께 찾는 방법] hyjeong
+++ bioinfo:pan-genome_analysis [2023/06/28 13:07] (current) – [Scoary: pan-genome-wide association study] hyjeong
@@ Line 254: / Line 254: @@
 Scoary의 입력물로는 gene_presence_absence.csv 파일과 더불어 trait table 파일(traits.csv)이 필요하다. Trait의 유무는 0과 1로 표현하되, 분석할 특성이 여러 개라면 콤마로 구분한다. 첫 컬럼은 균주명이고, 첫 줄은 제목에 해당한다. 다음은 trait table의 구조와 실행 사례이다.
+===== 읽어야 할 논문 =====
+[[https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-021-02473-1|Pandora: nucleotide-resolution bacterial pan-genomics with reference graphs]] Genome Biology (2021)