bioinfo:long_read_assembly_2024
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| bioinfo:long_read_assembly_2024 [2025/07/02 11:37] – hyjeong | bioinfo:long_read_assembly_2024 [2025/07/02 13:26] (current) – hyjeong | ||
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| * conda zga environment - canu, flye 등 long read assembly와 관련한 것이 여기에 설치되어 있다. | * conda zga environment - canu, flye 등 long read assembly와 관련한 것이 여기에 설치되어 있다. | ||
| - | 다시 이 문서를 이어서 쓰기 시작한 것은 2025년 여름이다. 같은 서버에서 conda 환경을 쓰지 않고 직접 필요한 프로그램을 소스로부터 깔아서 설치하였다(/ | + | |
| + | ===== minimap2-miniasm 파이프라인 ===== | ||
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| + | 다시 이 문서를 이어서 쓰기 시작한 것은 2025년 여름이다. 같은 서버에서 conda 환경을 쓰지 않고 직접 필요한 프로그램, 즉 **minimap2** 2.24-r1122와 **miniasm** 0.3-r179을 GitHub | ||
| #!/bin/bash | #!/bin/bash | ||
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| echo "✅ Finished! Final polished assembly: $BASENAME.racon2.fasta" | echo "✅ Finished! Final polished assembly: $BASENAME.racon2.fasta" | ||
| + | 이 스크립트를 이용하여 [[https:// | ||
bioinfo/long_read_assembly_2024.1751423838.txt.gz · Last modified: by hyjeong