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--- bioinfo:16s_rrna_amplicon_sequencing을_이용한_메타게놈_분석 [2023/08/17 12:58] – hyjeong
+++ bioinfo:16s_rrna_amplicon_sequencing을_이용한_메타게놈_분석 [2023/08/17 13:00] (current) – [QIIME1을 이용한 일루미나 16S rRNA 시퀀싱 데이터의 분석] hyjeong
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 ===== QIIME1을 이용한 일루미나 16S rRNA 시퀀싱 데이터의 분석 =====
-[[http://qiime.org/index-qiime1.html|QIIME 1]]은 v1.9.1을 끝으로 2018년 1월 QIIME 2로 공식 승계되어([[http://qiime.org/|관련 글]]) 더 이상의 기술적 지원은 이루어지지 않는다. 처음 공부하는 사람은 성능이 더욱 향상된 [[https://qiime2.org/|QIIME 2]]를 처음부터 배우기를 강력히 권고한다. 따라서 이 섹션은 기록 목적으로 작성되었음을 미리 밝혀 둔다.
+[[http://qiime.org/index-qiime1.html|QIIME 1]]은 v1.9.1을 끝으로 2018년 1월 QIIME 2로 공식 승계되어([[http://qiime.org/|관련 글]]) 더 이상의 기술적 지원은 이루어지지 않는다. 처음 공부하는 사람은 성능이 더욱 향상된 [[https://qiime2.org/|QIIME 2]]를 처음부터 배우기를 강력히 권고한다. 따라서 이 섹션은 '역사적' 기록 목적으로 작성되었음을 미리 밝혀 둔다.
 sequsequencing data를 다루기에는 QIIME 1이 아직 편리한 것 같다. 좀 더 정확히 말하자면 denoising step은 QIIME 1에서 실시한 다음 중간 결과물을 QIIME 2 로 임포트하여 후속 분석을 하는 것이 바람직하다고 여겨진다([[http://qiime.org/tutorials/denoising_454_data.html|'Denoising of 454 Data Sets']] 문서 참조). 다른 16S rRNA 분석 파이프라인으로는 [[https://mothur.org/|MOTHUR]]가 잘 알려져 있다.