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--- bioinfo:유전체_주석화_genome_annotation [2025/05/23 14:38] – [PGAP 사용하기] hyjeong
+++ bioinfo:유전체_주석화_genome_annotation [2025/05/23 14:49] (current) – [PGAP 사용하기] hyjeong
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   $ curl --silent "https://api.github.com/repos/ncbi/pgap/releases/latest" | grep -Po '"tag_name": "\K.*?(?=")' > VERSION
   $ cat VERSION
--07-18.build7555
+-05-06.build7983
-PGAP은 docker 환경을 사용하므로, 사용자는 관리자이거나 sudo 권한을 갖고 있어야 한다. PGAP 배포판에 포함된 샘플 유전체 서열을 대상으로 주석화를 실행하는 방법은 다음과 같다. pgap.py 스크립트는 /data/apps/pagp에 있다고 가정한다.
+PGAP은 docker 환경을 사용하므로, 사용자는 관리자이거나 sudo 권한을 갖고 있어야 한다. PGAP 배포판에 포함된 샘플 유전체 서열을 대상으로 주석화를 실행하는 방법은 다음과 같다. pgap.py 스크립트는 /data/apps/pagp에 있다고 가정한다. 파일이 설치되는 위치는 $HOME/.pgap을 기본으로 하지만 환경변수 PGAP_INPUT_DIR를 통해 임의로 지정할 수 있다.
   # docker가 실행 중인지 확인